Lämpötilaohjatun -kylmäketjupakkauksen perusvaatimus kuljetuksen aikana on varmistaa, että tuote pysyy määritellyllä lämpötila-alueella ja minimoida ulkoisten ympäristömuutosten vaikutukset pakkauksen sisälämpötilaan. Ennen kuljetusta sopiva lämpötilasäädelty pakkaus on valittava tavaroiden luonteen, kuljetusetäisyyden, vuodenajan lämpötilan ja arvioidun kuljetusajan perusteella. Pakkausmateriaalit, kylmäaineet ja eristetyt laatikot tulee tarkastaa etukäteen. Pakkaamisen aikana tuotteet ja kylmäaineet on järjestettävä määräysten mukaisesti, jotta vältetään suora kosketus tavaroiden ja matalalämpöisen kylmälähteen välillä, mikä voi aiheuttaa paleltumia tai lämpötilan poikkeavuuksia. Samanaikaisesti pakkauksen sisäiset raot tulisi minimoida kylmäenergian tasaisemman jakautumisen varmistamiseksi. Lämpötilaherkkien tuotteiden, kuten lääkkeiden ja tuoreelintarvikkeiden, lämpötilan tallennuslaitteet tulee määrittää tarpeen mukaan valvomaan lämpötilaa jatkuvasti tai ajoittain kuljetuksen aikana. Jos lämpötila ylittää määritellyn alueen, korjaaviin toimenpiteisiin on ryhdyttävä viipymättä ja asianmukaiset kirjaukset on säilytettävä sen varmistamiseksi, että lämpötilan nousu kuljetuksen aikana ei vaikuta tuotteen laatuun.
Varsinaisessa kuljetuksissa on kehitettävä vastaavat johtamisvaatimukset eri kuljetustapojen pohjalta. Lämpötilaohjatun-kylmäketjupakkauksen tulee välttää pitkäaikaista altistumista korkeille lämpötiloille, suoralle auringonvalolle tai sateelle ja lumelle. Latauksen ja purkamisen aikana pakkauksen avaamiseen ja pitämiseen kuluva aika tulee minimoida, jotta ulkoinen lämpö ei pääse sisälle. Kuljetusajoneuvot ja varaston siirtoalueet tulee pitää puhtaina ja ympäristön lämpötilaa on valvottava tuotevaatimusten mukaisesti, jotta lämpötilasäädelty pakkaus ei puristu, kolhi tai vaurioidu. Pitkän-etäisyyden kuljetuksissa pakkauksen tehokas lämpötilansäätöaika tulee laskea etukäteen ja varata tietty määrä turvaaikaa kuljetusreitin ja siirtojen määrän perusteella, jotta estetään liikenteen viivästysten aiheuttama lämpötilan säätelyn epäonnistuminen. Lisäksi kuljetuksen jälkeen lämpötilatiedot, pakkauksen kunto ja tuotteen kunto on tarkastettava, ja uudelleenkäytettävät lämpötilavalvotut pakkaukset on kierrätettävä, puhdistettava ja huollettava. Kohtuullisen konfiguroinnin ennen kuljetusta, tiukan valvonnan kuljetuksen aikana ja standardoidun hallinnan avulla kuljetuksen jälkeen kylmäketjun lämpötilaohjatun pakkauksen vakautta ja luotettavuutta voidaan parantaa varmistaen, että tuotteet ylläpitävät hyvät lämpötilaolosuhteet koko prosessin ajan varastosta poistumisesta lopulliseen toimitukseen.